Plus Shippingでは複数注文をひとつに統合することは出来かねます。
Plus Shipping ではShopifyの注文情報を同期しておりますので、以下ご案内のアプリ（有料）でShopifyの複数注文を統合していただければ、統合された注文がPlus Shipping に自動同期されます。
Save shipping costs by merging orders into a single order | Shopify App Store
尚、弊社にて動作確認することは出来かねますので、上記アプリ導入に関するサポートは上記アプリカスタマサポートへお問い合わせください。